Региональное духовное управление мусульман Челябинской области объединяет более 100 общин и имеет структурные подразделения: ахундство и 9 мухтасибатов:
Копейский мухтасибат
Троицкий мухтасибат
Красноармейский мухтасибат
Аргаяшский мухтасибат
Кунашакский мухтасибат
Верхнеуфалейский мухтасибат
Ахундство мухтасибатов горнозаводской зоны
Кыштымский мухтасибат
Магнитогорский мухтасибат
Их деятельность направлена на духовно-нравственное возрождение и развитие духовно-нравственных ценностей Ислама, и удовлетворение религиозных потребностей мусульман Южного Урала. Резиденция муфтия находится в Соборной мечети Челябинска ( «Ак мечеть» («Белая мечеть»)) по адресу: г. Челябинск, ул. Елькина, 16.
Первым руководителем мусульманской общины был имам-ахунд по Оренбургской губернии Шейх Ахмад-хаджи Рахманкулов. Впоследствии общину возглавляли: после гражданской войны указом муфтия Ризаэтдин-хазрата Фахретдинова имам-мухтасибом по Уральской области назначен Расулев Габдрахман Зайнуллович.
23 марта 1990 указом Верховного муфтия Талгата Таджуддина имамом-мухтасибом Свердловской и Челябинской области назначен Валеев Гумар Абдурахманович, 1938 года рождения.
В 1992 г. имамом-мухтасибом Челябинской области стал Шакаев Габдулла Юмабаевич.
В 1992 г. Указом Верховного муфтия, Председателя Центрального духовного управления мусульман России и Европейских стран СНГ от 21.10.92 № 35 Челябинский мухтасибат был преобразован в Региональное духовное управление мусульман Челябинской области (РДУМ), а Председателем Регионального духовного управления мусульман Челябинской области назначен Габдулла-хазрат Шакаев.
На съезде мусульман РДУМ Челябинской области 29 декабря 2005 г. Председателем ЦДУМ России, Верховным муфтием, Шейх-уль-Ислам Талгат Таджуддинном на должность председателя Регионального духовного управления мусульман Челябинской области в духовном звании муфтий назначен Ринат-хазрат Раев. На сегодняшний день Р.А.Раев является членом общественной палаты Челябинской области, членом Общественного Совета при ГУВД Челябинской области, членом Совета по взаимодействию с неправительственными организациями при Управлении Министерства Юстиции РФ по Челябинской области, членом Общественного совета по национальным вопросам при ЗСО Челябинской области, членом Межрелигиозного Совета по реализации свободы совести и религиозных объединений при Полпреде Президента РФ в УрФО. С 2008 года он назначен Главным муфтием по УрФО.
Понимая священный долг перед Отечеством, принимая во внимание многовековую историю традиций и обычаев России, в целях духовного возрождения и процветания многонационального и межконфессионального государства, стремясь расширить рамки сотрудничества, РДУМ Челябинской области одним из первых в РФ начало сотрудничество с органами государственной власти. Одним из первых субъектов РФ в УрФО ЦДУМ России и РДУМ 27 марта 2002 года подписали Соглашение о сотрудничестве между Полномочным представителем Президента Российской Федерации в Уральском федеральном округе и Председателем Центрального духовного управления мусульман России и муфтиями Региональных Духовных управлений мусульман ЦДУМ России Челябинским, Курганским, Свердловским, Ханты-Мансийским и Ямало-Ненецким Автономным округами. 27 июня 2013 года данное Соглашение было пролонгировано.
8 декабря 2010 г. подписано Соглашение о социальном партнерстве между Правительством Челябинской области в лице Губернатора Челябинской области М.В.Юревича и Региональным духовным управлением мусульман Челябинской области в лице муфтия Р.А.Раева. 11 апреля 2013 года аналогичное Соглашение заключили Администрация г.Челябинска и РДУМ Челябинской области. Соглашения о социальном партнерстве появились со многими субъектами области, муниципальными и административными образованиями, главами городов и районов.
Региональное духовное управление Челябинской области тесно взаимодействует с различными религиозными и общественными организациями. Так, 23 ноября 2011 года было подписано Соглашение с Челябинской и Златоустовской епархией Русской православной церкви. Ранее аналогичные Соглашение приняты со всеми общественными национально-культурными центрами Челябинской области.
С 2006 г. действует Соглашение между ГУФСИН РФ по Челябинской области и РДУМ Челябинской области.
С 2006 года издается газета «Хилял» (Молодая Луна), открыта бесплатная мусульманская библиотека в г.Магнитогорске. На челябинском телевидение, на канале ОТВ еженедельно выходит в эфир телепередача о Исламе «Хилял». Ежегодно организуется совершение паломничества (хадж) в священную Мекку.
При поддержке органов государственной власти и общественных организаций Челябинской области РДУМ Челябинской области проводит ежегодные праздничные торжества по случаю добровольного принятия нашими предками религии Ислам в Булгарах Республика Татарстан.
На протяжении многих лет при мечетях области работают летние лагеря для детей по изучению Основ традиционного Ислама и арабской грамматики. Для подведения итогов работы этих лагерей проводятся городские, районные олимпиады, победители которых принимают участие в ежегодном Всероссийском конкурсе «Я познаю Ислам» в Уфе.